Studia medyczne odbył w latach 1980 – 1986 na Wydziale Lekarskim Akademii Medycznej im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu. Po studiach podjął pracę w Instytucie Ortopedii i Rehabilitacji w Poznaniu początkowo w Klinice Ortopedii a następnie w nowopowstałej Klinice Ortopedii Dziecięcej Kierowanej prze prof. W. Marciniaka. Tam ukończył kształcenie podyplomowe I i II stopnia. W 1993 obronił pracę doktorską p.t.: „Pomiar kąta antetorsji szyjki kości udowej z użyciem ultrasonografii” – promotor prof. dr hab.. Witold Marciniak, a w 2000 roku: uzyskał stopień doktora habilitowanego pracą „Konfiguracja przestrzenna panewki stawu biodrowego po osteotomii miednicy według Degi w aspekcie badań morfologicznych, klinicznych i radiologicznych” Doświadczenie zawodowe Jarosława Czubaka to praca w Państwowym Szpitalu Klinicznym Nr 4 AM w Poznaniu, Instytut Ortopedii i Rehabilitacji AM 1986-1990 w charakterze asystenta, od 1990-2003 w Katedra i Klinika Ortopedii Dziecięcej AM w Poznaniu jako asystent, od 1993 adiunkt, od 2000 adiunkt habilitowany. Od 2003 roku pracuje w Klinice Ortopedii CMKP w Otwocku, początkowo jako Zastępca Kierownika Kliniki Ortopedii CMKP w Otwocku, a od 2007 roku Kierownik Kliniki Ortopedii, Ortopedii i Traumatologii Dziecięcej CMKP. W latach 2006-2010 pełnił funkcję Zastępca Kierownika Studium Kliniczno – Dydaktycznego (Prodziekan) w Centrum Medycznym Kształcenia Podyplomowego w Warszawie, a od 2010 roku jest Zastępcą Dyrektora Centrum ds. Dydaktycznych i Naukowych. Od 2007 roku na stanowisku profesora nadzwyczajnego CMKP. Od 2020 roku Dyrektor SPSK im. prof. A. Grucy w Otwocku. W okresie szkolenia odbył liczne staże zagraniczne i krajowe dotyczące zwłaszcza zagadnień patologii stawu biodrowego, poczynając od diagnostyki ultrasonograficznej noworodków aż po artroplastykę stawów. Głównym jego zainteresowaniem było i jest leczenie schorzeń stawu biodrowego z jego zachowaniem. Wprowadził w Polsce nowoczesne techniki operacyjne pozwalające na „naprawianie” stawu biodrowego: osteotomię okołopanewkową, chirurgiczne zwichnięcie stawu biodrowego, modyfikację osteotomii podgłowowej kości udowej. Popularyzuje zjawisko konfliktu udowo-panewkowego jako jednej z przyczyn choroby zwyrodnieniowej biodra. Wprowadził wraz z zespołem techniki komputerowego wspomagania chirurgii ortopedycznej w zakresie osteotomii miednicy, kości udowej i rekonstrukcji kończyn z użyciem aparatów Ilizarowa. Jest ekspertem EFORT w zakresie osteotomii miednicy od acetabulaplastyk u dzieci do osteotomii redyrekcyjnych u dorosłych. Zaangażowany w szkolenie podyplomowe lekarzy w zakresie traumatologii dziecięcej w ramach działania Europejskiego Towarzystwa Ortopedii Dziecięcej (EPOS), członek Educational Committee EPOS. Członek Komitetów Redakcyjnych wielu czasopism ortopedycznych (JPOB, JCO, JUltrs, OTR, POT) Zastępca Redaktora Naczelnego OTR i POT. Członek PTOiTr, ISMUS, EPOS, AAOS. Pełnił funkcję Prezydenta ISMUS, członka Board of EPOS, Członek Honorowy Czeskiego Towarzystwa Ortopedycznego, Laureat Nagrody Honorowej Niemieckiego Towarzystwa Ortopedii Dziecięcej, odznaczony medalem KEN. Zaangażowany w prace charytatywne sam i wraz z zespołem w Afryce (trąd), Indiach i na SriLance (POLIO, MPD, infekcje). Organizator pomocy polskiej traumatologii dziecięcej w ramach akcji Fundacji Wielkiej Orkiestry Świątecznej Pomocy (2x). Realizator wraz zespołem akcji Fundacji Polsat: Prosto do Europy po której pozyskał środki na budowę nowego Bloku Operacyjnego dla Kliniki i Szpitala Grucy w Otwocku.